Prof. K.H. Saifuddin Zuhri adalah seorang ulama, pendidik, pejuang kemerdekaan, sekaligus politisi. Kiprahnya sangat berpengaruh dalam pengembangan pesantren dan pendidikan Islam yang berbasis nilai-nilai tradisional tetapi relevan dengan kebutuhan masyarakat modern. beliau mendorong modernisasi pendidikan Islam dan menjadikan pesantren sebagai elemen penting dalam pembangunan bangsa. Ia juga menulis berbagai karya yang memperkuat pemahaman tentang sejarah, pendidikan Islam, dan kehidupan pesantren. Berangkat dari pemikiran Prof. K.H. Saifuddin Zuhri tentang pesantren, penelitian ini berfokus pada pendidikan berbasis nilai pesantren dalam pemikiran Prof. K.H. Saifuddin Zuhri. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui bagaimana pemikiran Prof. K.H. Saifuddin Zuhri mengenai pendidikan berbasis nilai yang ada di pesantren. Penelitian ini menggunakan metode penelitian sejarah tokoh dengan pendekatan biografi. Dari hasil penelitian ditemukan bahwa pemikiran Prof. K.H. Saifuddin Zuhri dilatarbelakangi beberapa aspek, yaitu: Latar Belakang Keluarga dan Pendidikan, Pengalaman Pribadi, Konteks Sosial dan Politik, Pengaruh Ulama dan Tokoh Pendidikan. Prof. K.H. Saifuddin Zuhri secara tersirat menjelaskan lima nilai, yaitu nilai keikhlasan, nilai kesederhanaan, nilai kemandirian, nilai ukhuwah islamiyah, dan nilai kebebasan. Nilai-nilai ini mencerminkan inti pendidikan pesantren yang bertujuan untuk membentuk karakter dan moral santri secara menyeluruh. Pesantren mengajarkan pentingnya niat yang tulus dalam setiap aktivitas, gaya hidup yang sederhana, kemandirian dan tanggung jawab, persaudaraan dan solidaritas di antara sesama Muslim, serta kebebasan berpikir kritis tanpa tekanan.